Boğaz ağrısı birçok hastalığın belirtisi olarak meydana gelebilir. Boğazda yanma ve hassasiyet olarak da görülen ve katı veya sıvı bir şey yutmakla ağrının arttığı gözlenen bu şikayetin bilinen en sık nedeni enfeksiyondur Enfeksiyonlara genellikle virüsler sebep olur. Ayrıca genelde çocuklar da görülen suçiçeği veya kızamık gibi virüs hastalıklarının da boğaz ağrısına sebep olabilmektedir. Daha az rastlanan bakteri'den kaynaklanan enfeksiyonlar boğaz ağrısına neden olur. Bademcik iltihabı bakteri kaynaklı boğaz ağrılarına bir örnektir. Ayrıca aşı yapılarak önlemler alınması ile genel anlamda sıklığı düşmüş durumda olan difteri ve boğmaca gibi bakteri türleri de sebepler arasında sayılabilir. Her bir sebebe karşı farklı çözüm yollarına başvurmak gerekir. Bilindiği üzere virüs hastalıklarına antibiyotik faydalı olmamaktadır.